層流手術(shù)室的空氣凈化系統(tǒng)本身并沒有殺菌功能，它是通過過濾塵埃極大限度地消除細菌附著的載體，而殘存的浮游菌及其他感染手術(shù)遺留的致病菌還會附著在醫(yī)療器具的表面及空氣中。鑒于目前百級以下的層流手術(shù)室多采用亂流潔凈室設(shè)計，所以還存在氣流循環(huán)死角，是手術(shù)室致污原因之一。
手術(shù)床墊、體位墊與手術(shù)病人接觸機會最多，術(shù)中體腔內(nèi)滲出液、膿液、血液最易遺留在手術(shù)床墊及體位墊上，屬于高度危險品。另外，手術(shù)間踏腳凳是醫(yī)護人員術(shù)中腳踩的矮凳，多為木制，由于鞋底頻繁接觸地面，因此污染機會較多，加之踏腳凳底部常被沖洗體腔的液體沾濕，利于細菌生長。
接送患者的推車同時出入有菌區(qū)、無菌區(qū)和清潔區(qū)，將大量的細菌帶入交換區(qū)，而外出的推車又將病房的細菌帶入交換區(qū)，推車上的被褥也常被手術(shù)病人的血跡、引流物污染，其他病人繼續(xù)使用時就會成為污染源。
手術(shù)室拖布是細菌滋生源和傳播病菌的載體。由于長年潮濕加之拖布中間的缺氧環(huán)境，極利于厭氧菌和銅綠假單胞菌的生長。用于清潔層流手術(shù)室地面時，勢必造成地面嚴重污染。洗器械的水池也是手術(shù)室細菌的滋生源，感染手術(shù)后的器械雖規(guī)定先用消毒液浸泡后清洗，但總有殘留的致病菌污染水池表面及下水孔周圍，再清洗其他物品時就會將細菌傳播到別處。
